完善环境管理制度，科学开发湾区资源。建立海域入海污染物总量控制制度，统筹海洋功能区与上游水功能区的环境要求，削减河流入海的总磷总氮等污染物总量，建立省级层面生态保护联防联控工作机制，加大跨行政区域的污染治理和执法力度，强化流域治理目标责任制和市县间河海交界方面的水质考核制度，实施入海污染物的溯源追究制度，建立入海统筹的生态修复和环境防治区域联动机制，促进海洋环境保护与流域污染治理的有效衔接。建立我省，最好是联合江苏、上海以及长江流域周边省市的生态赔偿、补偿机制，开展我省湾区海域进而扩展到长江口的环境整治与生态修复工程。

合理规划湾区的产业布局。制定产业准入标准，科学制定湾区经济发展规划，从决策源头上对产业发展布局、结构、规模等进行优化调整，明确限制或禁止不符合湾区发展要求的产业项目，严格控制、关停高污染企业，加大、加快化工企业搬迁改造工作，推行节能减排，加强污染防控，划定的近海区和功能保护区及时取缔和调整不合格的港口，制止各类污染源超标排海。